本作讲述了池田屋事件后铁之助在新撰组的生活以及在平静生活假象之下暗暗涌动的时代浪潮。日本将迎来一次惊天动地的变革，时代将掀起巨大的浪潮，所有人包括故事的主角们将无一例外地被时代的洪流所淹没……幕末，新撰组即将颠覆，明治维新的曙光开始闪现，是去是留，是生是死，每个人都到了选择的时刻。

在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。

十五世纪赫赫有名的两大家族——红蔷薇兰开斯特与白蔷薇约克所掀起的蔷薇战争。约克王朝的最后一任国王“理查德三世”，因为一个不为人知的天大秘密，一出生就被母亲视为恶魔之子。无法受到母亲关爱的理查德，便将协助自己的父亲登上王位视为活下去的最大动力。在一次偶然的机会下，理查德遇到了一位自称牧羊人的神秘男子，

铃木入间（村濑步 配音）被双亲卖给了魔王沙利文（黑田崇矢 配音），没想到沙利文因为没有子孙后代，所以对身为人类的铃木非常的溺爱。随着铃木渐渐长大，沙利文将他送进了恶魔学校巴比尔斯里深造，想要这所充满了恶魔的学校里生存下去，铃木的首要任务就是隐藏好自己的人类身份。

这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。

《政宗君的复仇》第二季，制作决定！